1912年中华民国成立。1月，孙文临时大总统宣言，“国家之本，在于人民合汉、满、蒙、回、藏诸地为一国，则合汉、满、蒙、回、藏诸族为一人，是曰民族之统一”。4月，袁世凯就任中华民国大总统，发布命令：“现在五族共和，凡蒙、藏、回疆各地方同为我中华民国领土，则蒙、藏、回疆各民族即同为我中华民国国民。”10月，大总统下令恢复达赖喇嘛封号，同时加封班禅。命令还说“在地方制度未经划一规定以前，蒙、藏、回疆应办事宜，均各仍照向例办理。”

但自达赖十三世在英国支持下，下令驱逐汉军，在西藏前后藏向汉军及联豫、钟颖等进攻，西康的土司、头人乘机取消改土归流，各地纷纷暴动，一时康藏局势大乱。袁世凯命四川督军尹昌衡率兵进入康藏平息战乱，称为征西军。7月间，川滇军进展，节节顺利。3个月平定康藏叛乱。

当时，川滇两路军队已会师澜沧江，准备直趋拉萨。在军事上来说，统一西藏是无问题的，尹昌衡已作了进攻拉萨的计划。但是袁世凯政府一心要得到帝国主义对他统治和做皇帝的支持，不惜倒行逆施，屈服英国的压力，下令停止尹昌衡的军事行动。

这时达赖正通过新疆督军袁大化，并又派人到打箭炉与北京政府商谈恢复关系的谈判。达赖十三世这时并没有“独立”的要求，只提出了在中国政权之下享有较大的自治权利。

点评：尹昌衡是辛亥革命元勋，曾任四川军政府都督。